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每当有新国家成立,唐宁总会给新国家一点新气象,什么糖衣炮弹呐,奇奇怪怪的建筑啊,诸如此类。这一次中华联邦成立恰好碰上北美马流感大爆发,从多伦多开始,一直蔓延到新英格兰地区,成了国际热门话题。
温莎帝国旗下的美国西部立即启动了严格检疫程序,趁机发一个《自然》的“号外”,公开温莎帝国旗下检疫机构的一种工作方法。即对出入境的马匹和驴、骡子等疫病受体进行基因检测。
首先要把马流感病毒的基因特征找出来,然后跟检疫结果对比。其中技术含量最高的是基因测序技术。也是《自然》号外成为爆款的原因。
唐宁在给《自然》“投稿”时,经常使用多个环球理工大学联盟成员的名义,使人不知道全是他一个人捣鼓出来的,这一次,他为了提振北京的知名度,使用了刚刚成立的北京大学巴斯德研究所的名义,你要去问巴斯德,他啥也不知道,自己看文章也看得津津有味。
《自然》公布的测序方法是脱氧核糖核酸链条聚合中止法,使用比正常dna还少一个氧的核苷酸来混入聚合反应,使大量的链条在随机位置加了一个双脱氧核苷酸就停止了复制,于是就得到了大量的长短不一的链条。
理论上,一百万个碱基对至少需要100万种长度的短链,这100万种短链的每一个都能被双脱氧核苷酸所标记,即可通过测这100万条短链的末端来得到整条长链的碱基对序列。
那么问题来了,你怎么知道末端是加了四种双脱氧核苷酸的哪种呢?《自然》这个号外妙就妙在解决了这个问题,把dna分成四份,每一份只加一种双脱氧核苷酸,所以能够肯定某一份dna是中终止于哪种双脱氧核苷酸,每一份dna中被标记之后唯一的不同就是链的长度。
再测链的长度就能够得到核苷酸的位置,这时可使用电泳的办法,让短链在电场中赛跑,越短的链条受到赛场(明胶)的阻力越小,跑得越远,以此可以得出所有短链的长度,一种长度对应一个位置,则测出某种核苷酸所有的位置,测四回,所有的信息就得到。
《自然》上的文章到此为止就结束了,其实,压箱底的本事是不会公布的,唐宁团队使用的方法可不是傻乎乎地人肉一个个去纪录电泳的结果,而是将dna链用荧光染色,电泳之后只需要分析感光元件上的成像就ok了。
这是非常经典的pcr,真正大规模测序时,电泳将成为速度瓶颈,唐宁真正的杀手锏是根本不用电泳,一次短链赛跑要耗费20分钟以上,伤不起。所以高通量检测技术就要诞生了。
高通量的核心原理还是受到pcr的启发,分成四组,每一次加入四种核苷酸,但其中只有一种是起酶级联反应作用,一种化学物催化另一种,一共多达四种,联合成一个反应链条,最后的目标是让dna复制时一边生长一边发光,在这个链条生成的时间线上就会出现一个又一个的峰值,清晰地把某种核苷酸在链条上的位置显示出现。
这是以其中一种核心的能量传递物命名的,叫焦磷酸测序法。它的速度就堪称神迹了,能够在一次反应中对数以百万计的样品进行分析。
dna分子太大,经常被切成非常多的样品才分析。在医学与检疫中,有时各种生物的dna分子很杂乱堆在一起,也可以混在一起同时测。
人类的dna有约30亿个碱基对,如果只用pcr方法,需要几十年的功夫来测,而焦磷酸法所耗时竟可以“天”为单位,所产生的巨额数据反而成了分析的难点。这个神技唐宁暂不会公开,pcr的论文就已经很轰动了。
北京大学一战成名,成了生物学领域的翘楚,咨询与真正报考的中国学子多如过江之鲫,北京原住民就纳闷了,咋地一下子来了这么多四眼的洋鬼子?
温莎洲际帝国为每个洲都设立了一个基因测序中心,亚洲的放在北京,欧洲的放在卢森堡,北美的放在西雅图,(又是西雅图,jet已经放在这里,再来加一把劲,因为要分散人口已经扩张得非常厉害的旧金山),南美则是在里约热内卢,非洲也有一个,在非洲最大湖维多利亚湖边上的堪培拉。
这都是第一批,其实印度、以色列、苏联等大国稍后也会拥有测序中心。为了阻止马流感的蔓延,身为协约国的美国、加拿大不得不在用马来从事畜牧业因而损失惨重的牧民的压力下屈尊,把海关检疫部门外包给温莎科技帝国,纽约的海关每天都有航班飞往西雅图,只为更准确地为马匹、骡子等家畜测病毒基因。
协约国的生物学家其实还很纳闷呢,如果照pcr的那种检测效率,西雅图基因测序中心不可能每天都按时完成那么大量的样品测序,不是忽悠我们的吧?
纳闷也没办法,协约国科学家已经初步重现了pcr的工作,认为它是靠谱的。而他们只能在实验室里小批量测序,暂时没有能力组建自己的检测中心。
再一次又看出国民性来,美国、英国、荷兰、加拿大等国都纷纷外包检疫部门,日本犹豫再三,也加入了这个行列,而法国、普鲁士、大清、俄国仍然死守阵地,以政治代替理性,大不了绝对不让外国的马匹传入!大清甚至连牛肉、猪肉都禁了,一切牲口禁入。
你看这大清的德性就知道民间主体之不理性,因此,唐宁很感慨,决定中华联邦减弱民意对行政的干扰,实行学术委员会掌握领导权的自治方案。
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